MBR膜系統產水泵出口需設置轉子流量計以及手動調節閥門調節流量，如未設置出口手動閥調節產水流量，在MBR膜組件處于新膜狀態或剛剛進行離線后較為通暢時，如設計10m3/H往往實際產水量在15m3/h甚至更大，這樣的運行極大的增加MBR膜的污堵。

根據MBR膜系統設計的實時產水量進行控制這是MBR膜的設計參數也與MBR膜系統設計時的配套裝置膜數量以及膜元件預計壽命息息相關。例如設計15L/㎡/H及每平方米膜每小時通量15L,設計通量是根據MBR膜能在一定清洗周期下穩定運行的設計量參數，當實際運行超過這個數值MBR膜預先設定的反洗流量，清洗周期，曝氣量均不滿足能使MBR膜穩定運行的壽命，故而MRB膜的設計通量需要嚴格把控，不可隨意增大。

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